网站后台模板关联自己做的网站,网站建设服务器什么意思,wordpress全自动采集,免费网站模板大全R语言的优势在于批量处理#xff0c;常使用到循环和函数#xff0c;三线表是科研文章中必备的内容。利用函数实现自动判断数据类型和计算。使用R包#xff08;table1#xff09;。
# 创建连续性变量
continuous_var1 - c(1.2, 2.5, 3.7, 4.8, 5.9)
continuous_var2 常使用到循环和函数三线表是科研文章中必备的内容。利用函数实现自动判断数据类型和计算。使用R包table1。
# 创建连续性变量
continuous_var1 - c(1.2, 2.5, 3.7, 4.8, 5.9)
continuous_var2 - c(10.5, 20.3, 15.2, 8.7, 12.1)
continuous_var3 - c(0.3, 0.7, 1.1, 2.0, 1.5)# 创建分类变量
category_var1 - factor(c(A, B, A, C, B))
category_var2 - factor(c(X, Y, Z, X, Z))
category_var3 - factor(c(High, Low, Medium, Medium, High))# 创建data.frame
df - data.frame(ContinuousVar1 continuous_var1,ContinuousVar2 continuous_var2,ContinuousVar3 continuous_var3,CategoryVar1 category_var1,CategoryVar2 category_var2,CategoryVar3 category_var3
)# 显示data.frame
df
#generate three line table
#pvalue
pvalue - function(x, name, ...){y - df[[name]]#variableg - df[,Group]#Groupif (is.numeric(y)) {if (shapiro.test(y)$p.value0.05){p - t.test(y ~ g)$p.valuep_with_symbol - paste0(format.pval(p, digits 3, eps 0.001), *)}else{p - wilcox.test(y ~ g)$p.valuep_with_symbol - paste0(format.pval(p, digits 3, eps 0.001), **)}}else{if (length(y) 40 any(sapply(chisq.test(y,g)$expected, function(x) x 1))){p - chisq.test(y, g)$p.valuep_with_symbol - paste0(format.pval(p, digits 3, eps 0.001,trim FALSE), #)} else {p-fisher.test(y,g)$p.valuep_with_symbol - paste0(format.pval(p, digits 3, eps 0.001), ##)}}c(, p_with_symbol)
}#自定义函数准备显示统计值(t值或卡方值)
stat_value - function(x, name, ...) {y - df[[name]] # 变量g - df[,Group] # 分组变量if (is.numeric(y)) {# 连续变量使用 t 检验或 Mann-Whitney U 测试if (shapiro.test(y)$p.value 0.05) {s - abs(t.test(y ~ g)$statistic[[t]]) # 正态分布使用 t 检验} else {s - wilcox.test(y ~ g)[[statistic]][[W]] # 非正态分布使用 Mann-Whitney U 测试}} else {if(length(y) 40 any(sapply(chisq.test(y,g)$expected, function(x) x 1))){s-chisq.test(y, g)$statistic[[X-squared]]} else {s-fisher.test(y, g)$statistic[[X-squared]]}# 分类变量使用卡方检验s - chisq.test(y, g)$statistic[[X-squared]]}c(, format.pval(s, digits3, eps0.001))
}
#定义变量的展现形式
# rndr - function(x, name, ...) {
# if (!is.numeric(x)) return(render.categorical.default(x))
# what - switch(name,
# Age Median [Min, Max],
# Survival months Median [Min, Max]
# )
# parse.abbrev.render.code(c(, what))(x)
# }
#绘图
library(table1)
paste(sprintf(%s,colnames(df)),collapse)
df$Group-c(rep(A,2),rep(B,3))
table-table1(~ContinuousVar1ContinuousVar2ContinuousVar3CategoryVar1CategoryVar2CategoryVar3|Group,enderrndr,datadf,extra.collist(Statisticsstat_value,P-valuepvalue))#保存为docx
library(flextable);help(packageflextable)
table_fl-t1flex(table)
save_as_docx(table_fl,pathtable.docx)
