如何创建自己的公司网站,wordpress页面调试分类文章,wordpress文章自定义栏目,wordpress文章编辑器最近关注了一下RiboSeq的分析方法#xff0c;方法挺多的#xff0c;但是无论哪种软件#xff0c;都会存在或多或少的问题#xff0c;一点问题不存在的软件不存在#xff0c;问题的原因出在#xff0c;1.有的脚本是用python2编写的#xff0c;目前python2已经不能用了 2.…最近关注了一下RiboSeq的分析方法方法挺多的但是无论哪种软件都会存在或多或少的问题一点问题不存在的软件不存在问题的原因出在1.有的脚本是用python2编写的目前python2已经不能用了 2.有的没有安装权限 3.有的package过于老旧已经和python3不兼容了
1.RiboTaper
按照官方流程分析
1.1 直接运行create_annotations_files.bash
1.2 直接运行create_metaplots.bash
1.3 直接运行Ribotaper.sh
这一步脚本的步骤比较多并且中途会报错接下来就需要自己调整脚本运行了 3.1
nohup /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec/tracks_analysis_multiprocessing.R nonccds 10 /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec nohup /datapool/life-zhanghk/liji/01software/miniconda3/envs/py3.8/libexec/annotate_exons.R ../annotation/ 10